【分析を申し込むために】
5.　各種分析項目について

5-2.　タンパク質同定

概要

タンパク質酵素消化後のペプチド断片を nanoLCに供し，溶出する画分の MS/MSスペクトルをデータベース解析することにより，タンパク質の同定を行います．

残念ながら，当部門ではゲル片での取扱は出来ませんので，ご了承ください．提供ペプチド溶液をそのまま分析に供します．

試料の準備

• SDS-PAGE等を行った後，ゲル片を脱色，還元アルキル化などの必要な処理を行い，トリプシン等にてゲル内消化を行ってください．消化されたペプチド断片を抽出し，脱塩処理の後，濃縮，0.1％ギ酸／数％アセトニトリル水溶液としてご用意ください．
• 溶液内消化をされた場合にも，最終試料溶液を0.1％ギ酸／数％アセトニトリル水溶液としてご用意ください．
• 提出量は　1pmol　以上

   

  前処理の過程で取り込まれるケラチンの混入に注意が必要です．　

  界面活性剤, 塩類は除去してください．

  

申込時の留意点

• GFC総合システムへログインの上、マイページ＞機器分析受託＞分析申し込みを選択ください。
• 質量分析のMass Spectrometry (nanoLC/MS/MS + protein analysis using database search)を選択してください．
• 分析項目の選択欄では、グラジエント設定の異なる3 タイプ（60 分、120 分、180 分コース）を用意しています。電気泳動等で分離精製後の酵素消化物を提出される場合には、60 分もしくは120 分コースを選択してください。（スクリーニング的にご利用される場合には60 分、より分離良く分析されたい場合には120 分コースを選択される方が多いです。）
• 多検体同時に依頼される場合や複数回測定を依頼される場合には、2 測定目以降の料金が割安になっています。例えば3 サンプル各1 測定を依頼される場合には、1 測定目×１、2 測定目以降×２ と申し込みしてください。
  
• 解析予定のバンドに印をつけたゲルの染色画像を用意し，申込時にアップロードしてください．
• 分析試料が複数の場合には，分析順番のご希望を申込書に記載してください．
• 各試料の希望測定回数を記載してください．（ｎ回分析希望の場合には，ｎ回分の料金が必要です．）

 

【タンパク質同定　申込書記載内容　一覧】

　　試料本数,　試料名, 　提出試料溶液の組成,　 染色方法, 　目的タンパク質の分子量, 　提出試料量,

　　S-S結合還元処理の有無，　使用酵素名，　サンプルの由来（生物種），　修飾の有無

　　その他　（界面活性剤使用の場合は、その種類を記載してください．)

返却データについて

• ご希望のデータベースにて解析を行った結果は，エクセル形式のファイルに変換し，GFC総合しシステムにアップロードして返却します．
• ご希望の方には，Mascot検索可能な形式にファイルを変換してお渡ししますので，申込書にその旨を記載してください．（別料金）
• 後日，再度条件を変更して検索を行いたい場合には，別料金にて承ります．
• 一つのサンプルについて，ｎ回データを取得したい場合には，ｎ回分の分析料金がかかります．

納期について

• 当部門の装置は，タンパク質同定のみならず，有機構造解析のためのLC/MS, MS/MSなど多種多様な化合物を分析対象としています．　そのため，装置調整には専用機以上に時間がかかります．
• タンパク質同定測定の依頼が続く場合には，1週間程度で分析結果をお返しすることが可能ですが，他の項目の分析が入っている場合には，時によって1か月程度お待たせすることがございます．
• ご依頼前に，状況について分析スタッフへご確認くださいます様，お願い申し上げます．

質量分析担当：内線9214 　岡まで

2023.11.21